南美白对虾肝肠孢子虫病是由一种微孢子虫寄生引起的，孢子很小，长2～10微米、宽1.5～4.2微米，先是感染对虾肠道表皮，进而感染肝胰腺，寄生在虾肝胰腺管上皮细胞中，肉眼和光学显微镜很难发现，用PCR等技术才能确诊。染病的对虾不长个，偶尔伴有白便，刚染病的虾肠道吸收功能下降，严重的出现肠炎和肝胰腺萎缩，有些染病个体虽食欲正常，但是体瘦、壳薄、身体柔软。染病的养虾塘通常能出现5种不同规格的虾，但是值得注意的是，不是所有的生长缓慢都是由虾肝肠孢子虫引起的。如养殖过程管理不好、投料不足、投苗密度过大、养殖塘pH值过低(一般在7以下)均会导致对虾出现生长缓慢情况。另外，有一些病原体也会造成对虾生长缓慢，如ihhn(传染性皮下及造血组织坏死病*)。
微孢子虫的检测方法：电镜检查病原体是目前最可靠的诊断方法，利用染色的活组织印片、涂片或切片光镜检查，也具有诊断价值，且易于推广。粪便直接涂片用改良三色液染色，孢子壁呈鲜樱红色。
如果发现轻微情况可尝试用苦楝10-20份、贯众10-20份、百部5-15份、雷丸20-30份、青葙子15-25份、钩吻20-30份、槟榔15-25份。服用方法为：将上述原料药物研磨成粉混合后掺入饵料中进行投喂，药物占饵料重量的1‰-10‰。该中药组合物对南美白对虾生长无*副作用，施用后对虾生长速度快，产量高，经济效益显著，是一种成本低、防治效果明显、可通过载体口服的中草药。该病有较强的传播性，一旦发病，会传染到第二茬甚至第二年的养殖，所以必须引起足够的重视。肠孢子虫生命力很强，用水产养殖中常用的氯类消*剂很难灭杀，发病后应采取以下措施：一是把好进苗关，不让病苗入塘；
虾苗挑选
池塘蓄养的亲虾，特别是投喂感染EHP的活饵的，感染EHP的机率会非常高，因为EHP能通过粪便传播。只要用沙蚕、蛤肉、鱿鱼和本地丰年虫饲养的亲虾，感染EHP的风险都会升高。如果必须使用活饵，建议还是经过冷冻、巴氏消*或者X射线消*以后再使用。
亲虾的培育池一定要清洗干净，完全干燥，然后用氢氧化钠消*。所有的设备包括气管水管，容器都要在2.5%的氢氧化钠溶液中浸泡至少3个小时。浸泡完以后剩下的氢氧化钠溶液要冲走，不要留着它用了。经过浸泡设备要充分凉干，在使用它们之前用ppm、PH低于4.5的盐酸喷洗处理。EHP有非常强的耐受力，想通过以上的处理方法把它完全干掉有点难度，但是我们的主要目的不是要消灭它，而是要减少它的数量水平。
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清理虾卵和无节幼体：相关的育苗人员说，用适合浓度的碘或甲醛溶液能减少EHP附着于卵和无节幼的风险，同样这种方法也可以控制其它的细菌传播，比如EMS。
严格的池塘清塘处理
池塘的有机质越多，患微孢子虫的风险越高，这可能与微孢子虫的中间寄主的生活环境有关。因此在放苗前，还是建议要彻底地清塘消*为妙。具体的做法就是彻底清淤了，还用就是用强碱性的消*物质如氢氧化钠，生石灰等处理塘底，使池塘底部的PH达到12，这样能有效杀灭大部分的微孢子虫。
推荐了一个有效的方法：每亩地用公斤以上的生石灰处理塘底，然后塘底要完全晒干。有条件的养殖户翻耕塘底10厘米左右，使生灰与底泥充分混合，然后加水使生石灰作用，如果操作得当，塘底的PH值能达到12，并用保持一段时间，可以有效杀灭微孢子虫。(PS.这个操作工程量相当大)。
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